Detecção de Vírus em Águas Ambientais de Florianópolis 2023

26/01/2023 16:33
Pesquisa de vírus entéricos em surto de gastroenterite – Florianópolis-SC 2023

Vigilância Epidemiológica Ambiental Integrativa
Referência: Ação de Extensão integrante do projeto – Vigilância Epidemiológica Ambiental Integrativa – VigEAI – LVA-MIP-CCB-UFSC

 

Parceiros: Laboratório de Ficologia – CCB – UFSC

O objetivo: Realizar análises de vírus entéricos em amostras ambientais – águas salobras e marinha por meio de concentração viral usando floculação orgânica, seguido de testes moleculares.

AMOSTRAGEM E METODOLOGIA

Um total de 10 amostras ambientais (praia e foz de rio) foram coletadas e processadas para busca da presença de Rotavírus-A, Norovírus Humano e Vírus da Hepatite A.

Pontos amostrados em Florianópolis – SC.

Ponto1: Mar – Foz do Rio Sangradouro

Ponto 2: Mar –  Ribeirão da Ilha

P3: Rio Campeche

P4: Lagoa da Conceição – Osni Ortiga

P5:   Mar – Barra da Lagoa

P6: Mar – Foz Rio Capivari

P7: Mar –  Foz do Rio do Brás

P8: Mar – Santo Antônio de Lisboa

P9: Mar – Foz Rio Itacorubi

P10: Mar – Central Beira Mar Norte

 

Resumidamente: As amostras foram recebidas nas dependências do Laboratório de Virologia Aplicada do MIP-CCB-UFSC e processadas para a concentração de partículas virais.

O RNA viral foi extraído dos concentrados usando o kit comercial.
O RNA viral foi detectado por método molecular baseado em RT-PCR em tempo real usando kit OneStep qPCR Quantinova (QIAGEN, Alemanha) e oligonucleotídeos e sonda previamente descritos para regiões  virais específicas de HAV, RVA e HuNoV-GI de acordo com o descrito por Jothikumar tt Al. (2005), Zeng et Al. (2008) e Kageyama et Al. (2003), respectivamente.

 

– Controle interno Viral validado – Norovírus murino

– Método utilizado: RT-qPCR TaqMan usando sondas e iniciadores específicos para os alvos virais.


 

RESULTADOS:
Na Tabela 1 encontram-se as identificações amostrais e resultados obtidos para fins de comunicação à VISA/Florianópolis e divulgação epidemiológica.

Número da amostra / Codificação Tipo de amostra (fezes, esgoto, água) Data da Coleta (se tiver) Norovírus – Genótipo I (HuNoV-GI) Rotavírus – A (RVA) Vírus da Hepatite A (HAV)
Ponto1: Mar – Foz do Rio Sangradouro Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
Ponto 2: Mar –  Ribeirão da Ilha Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
P3: Rio Campeche Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
P4: Lagoa da Conceição – Osni Ortiga Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
P5:   Mar – Barra da Lagoa Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
P6: Mar – Foz Rio Capivari Água 16/01/2023 Detectado
(CT: 34)
Não detectado Não detectado
P7: Mar –  Foz do Rio do Brás Água 16/01/2023 Detectado

(CT: 33)

Não detectado Não detectado
P8: Mar – Santo Antônio de Lisboa Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
P9: Mar – Foz Rio Itacorubi Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado
P10: Mar – Central Beira Mar Norte Água 16/01/2023 Não detectado Não detectado Não detectado

Resultados – Reconferido e confirmados em réplicas e duplicatas.

CT: Ciclo de amplificação

 

INTERPRETAÇÃO:

Das amostras avaliadas, os pontos P6: Mar – Foz Rio Capivari e P7: Mar –  Foz do Rio do Brás apresentaram positividade para Norovírus Humano Genótipo I (HuNoV-GI).

Não houve detecção do vírus da Hepatite A (HAV) nem de Rotavírus A (RVA) nas amostras avaliadas.

Nota:

Os Norovírus, detectados nesse estudo são vírus feco-orais, patogênicos, responsáveis por surtos gastroentéricos, sendo propagados principalmente por via alimentar. Porém, estes podem ser transmitidos pela via hídrica e por aerossóis provenientes de fezes e vômito de pacientes infectados.

Recomenda-se fortemente a ampliação da vigilância em pacientes e águas, bem como em amostras de alimentos, principalmente de consumo direto ou minimamente processados (hortaliças e outros).