Pesquisa de vírus entéricos em surto de gastroenterite – Florianópolis-SC 2023 |
Vigilância Epidemiológica Ambiental Integrativa
Referência: Ação de Extensão integrante do projeto – Vigilância Epidemiológica Ambiental Integrativa – VigEAI – LVA-MIP-CCB-UFSC
Parceiros: Laboratório de Ficologia – CCB – UFSC
O objetivo: Realizar análises de vírus entéricos em amostras ambientais – águas salobras e marinha por meio de concentração viral usando floculação orgânica, seguido de testes moleculares.
AMOSTRAGEM E METODOLOGIA
Um total de 10 amostras ambientais (praia e foz de rio) foram coletadas e processadas para busca da presença de Rotavírus-A, Norovírus Humano e Vírus da Hepatite A.
Pontos amostrados em Florianópolis – SC.
Ponto1: Mar – Foz do Rio Sangradouro
Ponto 2: Mar – Ribeirão da Ilha
P3: Rio Campeche
P4: Lagoa da Conceição – Osni Ortiga
P5: Mar – Barra da Lagoa
P6: Mar – Foz Rio Capivari
P7: Mar – Foz do Rio do Brás
P8: Mar – Santo Antônio de Lisboa
P9: Mar – Foz Rio Itacorubi
P10: Mar – Central Beira Mar Norte
Resumidamente: As amostras foram recebidas nas dependências do Laboratório de Virologia Aplicada do MIP-CCB-UFSC e processadas para a concentração de partículas virais.
O RNA viral foi extraído dos concentrados usando o kit comercial.
O RNA viral foi detectado por método molecular baseado em RT-PCR em tempo real usando kit OneStep qPCR Quantinova (QIAGEN, Alemanha) e oligonucleotídeos e sonda previamente descritos para regiões virais específicas de HAV, RVA e HuNoV-GI de acordo com o descrito por Jothikumar tt Al. (2005), Zeng et Al. (2008) e Kageyama et Al. (2003), respectivamente.
– Controle interno Viral validado – Norovírus murino
– Método utilizado: RT-qPCR TaqMan usando sondas e iniciadores específicos para os alvos virais.
RESULTADOS:
Na Tabela 1 encontram-se as identificações amostrais e resultados obtidos para fins de comunicação à VISA/Florianópolis e divulgação epidemiológica.
Número da amostra / Codificação |
Tipo de amostra (fezes, esgoto, água) |
Data da Coleta (se tiver) |
Norovírus – Genótipo I (HuNoV-GI) |
Rotavírus – A (RVA) |
Vírus da Hepatite A (HAV) |
Ponto1: Mar – Foz do Rio Sangradouro |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
Ponto 2: Mar – Ribeirão da Ilha |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
P3: Rio Campeche |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
P4: Lagoa da Conceição – Osni Ortiga |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
P5: Mar – Barra da Lagoa |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
P6: Mar – Foz Rio Capivari |
Água |
16/01/2023 |
Detectado
(CT: 34) |
Não detectado |
Não detectado |
P7: Mar – Foz do Rio do Brás |
Água |
16/01/2023 |
Detectado
(CT: 33) |
Não detectado |
Não detectado |
P8: Mar – Santo Antônio de Lisboa |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
P9: Mar – Foz Rio Itacorubi |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
P10: Mar – Central Beira Mar Norte |
Água |
16/01/2023 |
Não detectado |
Não detectado |
Não detectado |
Resultados – Reconferido e confirmados em réplicas e duplicatas.
CT: Ciclo de amplificação
INTERPRETAÇÃO:
Das amostras avaliadas, os pontos P6: Mar – Foz Rio Capivari e P7: Mar – Foz do Rio do Brás apresentaram positividade para Norovírus Humano Genótipo I (HuNoV-GI).
Não houve detecção do vírus da Hepatite A (HAV) nem de Rotavírus A (RVA) nas amostras avaliadas.
Nota:
Os Norovírus, detectados nesse estudo são vírus feco-orais, patogênicos, responsáveis por surtos gastroentéricos, sendo propagados principalmente por via alimentar. Porém, estes podem ser transmitidos pela via hídrica e por aerossóis provenientes de fezes e vômito de pacientes infectados.
Recomenda-se fortemente a ampliação da vigilância em pacientes e águas, bem como em amostras de alimentos, principalmente de consumo direto ou minimamente processados (hortaliças e outros).